Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB28P51157 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms