Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLK1P49759 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLK1P49759 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms