Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK1EP49674 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms