Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK8P49336 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK8P49336 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK8P49336 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK8P49336 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms