Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NESP48681 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NESP48681 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NESP48681 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NESP48681 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NESP48681 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NESP48681 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NESP48681 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms