Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRATP43155 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRATP43155 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRATP43155 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRATP43155 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms