Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GGCXP38435 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GGCXP38435 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GGCXP38435 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GGCXP38435 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms