Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP5C1P36542 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms