Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM23P36406 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms