Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms