Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA4P34932 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms