Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBP1P32455 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GBP1P32455 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms