Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX2P32243 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX2P32243 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX2P32243 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX2P32243 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms