Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TTTY7-201ENST00000276770 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TTTY7B-201ENST00000276779 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SDR16C6P-202ENST00000524136 955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 BLOC1S6-208ENST00000565323 688 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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