Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC27P30260 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC27P30260 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC27P30260 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC27P30260 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms