Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID4AP29374 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms