Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB2P29033 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms