Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms