Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARK3P27448 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARK3P27448 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARK3P27448 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARK3P27448 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MARK3P27448 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARK3P27448 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARK3P27448 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARK3P27448 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms