Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNCP24821 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNCP24821 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNCP24821 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNCP24821 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms