Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1P21675 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1P21675 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1P21675 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1P21675 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1P21675 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1P21675 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1P21675 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1P21675 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1P21675 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms