Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB4AP20338 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB4AP20338 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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