Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGCP20142 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGCP20142 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGCP20142 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PGCP20142 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGCP20142 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms