Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMY2BP19961 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms