Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms