Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT1P17948 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT1P17948 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLT1P17948 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLT1P17948 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FLT1P17948 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT1P17948 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT1P17948 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT1P17948 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms