Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD44P16070 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD44P16070 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD44P16070 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD44P16070 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms