Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB3P14651 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms