Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A1P13866 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms