Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLBP1P12271 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLBP1P12271 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms