Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms