Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1P11387 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOP1P11387 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOP1P11387 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms