Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSAP10619 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSAP10619 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSAP10619 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSAP10619 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSAP10619 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSAP10619 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSAP10619 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSAP10619 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSAP10619 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms