Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2AF1L5P0DN76 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2AF1L5P0DN76 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms