Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGPD1P0DJD0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms