Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4AP0C0L4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms