Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms