Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOA4P06727 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOA4P06727 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOA4P06727 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOA4P06727 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOA4P06727 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms