Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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