Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN5O75503 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN5O75503 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN5O75503 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN5O75503 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN5O75503 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN5O75503 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN5O75503 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN5O75503 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms