Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF3O75054 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms