Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC11O43248 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC11O43248 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC11O43248 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC11O43248 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms