Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCAO15360 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCAO15360 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FANCAO15360 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FANCAO15360 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FANCAO15360 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FANCAO15360 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCAO15360 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms