Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VGFO15240 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGFO15240 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGFO15240 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGFO15240 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VGFO15240 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VGFO15240 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VGFO15240 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGFO15240 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGFO15240 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms