Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIP1O00291 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIP1O00291 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms