Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KR12 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3KR12 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KR12 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KR12 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KR12 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms