Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF879B4DU55 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF879B4DU55 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms