Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3BA8MYP8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms