Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms