Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L4A6NCW7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms